1、進口糧食指定口岸。2014年，太倉萬方碼頭（僅限木薯干）和現代集裝箱碼頭順利通過國家質檢總局驗收，獲得“進口糧食指定口岸”資質。設立太倉港進口糧食指定口岸，可直接從越南、泰國、緬甸等國進口糧食，有利于降低進口糧食物流成本，推動華東地區糧食物流業聚集發展。

2、進境水果指定口岸。2011年，太倉港被國家質檢總局批準為進境水果指定口岸，這也是我省第三家擁有進境水果資質的口岸。設立太倉港進境水果指定口岸資質，利用太倉港在進境水果采購、倉儲、運輸等方面的優勢，可直接吸引臺灣、東南亞水果來太倉港集散。

3、進口俄羅斯、美國和加拿大帶皮未處理原木指定進境口岸。太倉港自2001年底首次開展進口木材業務以來，業務發展迅猛，目前已成為全國海運木材進口第一大港。太倉港擁有長三角唯一的國家級木材檢疫除害處理區，形成了貿易、代理、倉儲、銷售、運輸一條龍產業鏈。

4、進境食用水生動物指定口岸。2016年7月29日，太倉港順利通過國家質檢總局現場驗收，獲批進境食用水生動物指定口岸。依托日本快航，太倉港主要開展了帝王蟹、紅毛蟹、北極貝、石斑魚、鮑魚等日本食用高端鮮活水產品的進口業務。